Στα €8,2 εκατ. περίπου ανήλθαν μέχρι τα τέλη του 2018 οι επιστροφές φόρου προστιθέμενης αξίας (ΦΠΑ) σε μονές και ναούς λόγω οικοδομικών και άλλων εργασιών που πραγματοποίησαν. Οι επιστροφές ΦΠΑ για κατασκευαστικά έργα σε μονές και ναούς γίνονται στη βάση απόφασης του Υπουργικού Συμβουλίου που λήφθηκε τον Μάρτιο του 2012. Στη συμφωνία περιλήφθηκε και σχετική πρόνοια ώστε να περιλαμβάνονται στις εργασίες που το κράτος θα πρέπει να επιστρέφει το ΦΠΑ στην Εκκλησία και κατασκευές που γίνονται στο προαύλιο των ναών και αφορούν αίθουσες δεξιώσεων για γάμους.
Συγκεκριμένα, το σημείο 13 της συμφωνίας μεταξύ κράτους και Εκκλησίας προβλέπει τα εξής: «Η Εκκλησία της Κύπρου απαλλάσσεται από την καταβολή ΦΠΑ για την ανέγερση και συντήρηση ναών και ακινήτων που βρίσκονται στον περίβολο του ναού και χρησιμοποιούνται για την επιτέλεση του θρησκευτικού της έργου».